混合性厌氧菌感染的检查目的是检测细菌的种类。常见的检查有：
1、细菌培养
所有标本均应作革兰氏染色和需氧培养，厌氧培养应置于特殊的培养基，孵育48～72小时，然后检查。
2、标本涂片检查
在对标本作厌氧菌培养的同时进行涂片镜检，可早期把有厌氧菌生长的信息提供给临床，如普通需氧培养无细菌生长，但直接涂片见到大量细菌者，即可考虑为厌氧菌感染；如普通培养只有一种细菌生长但直接涂片可见两种或以上细菌者，可考虑患者为混合感染。
3、厌氧菌药敏试验
应该是严格的，需经国家临床检验标准指导委员会确认，但若菌种是已知的，则药敏情况可预先推测，因此很多实验室不作常规的厌氧菌药敏试验。
