急性粒细胞缺乏的主要并发症为感染，严重者可并发败血症。肺部的严重感染引起咳嗽、呼吸困难、紫绀。发生败血症时可伴肝损害，出现肝大、黄疸。严重者可伴中毒性脑病或中枢神经系统感染，出现头痛、恶心、呕吐、意识障碍，甚至昏迷。若短期内不恢复，死亡率极高。
