肝内胆管结石发病原因与胆道的细菌感染、寄生虫感染及胆汁滞留有关。结石几乎全是胆红素钙石，由胆红素、胆固醇、脂肪酸与钙组成。可为双侧肝内胆管结石，也可限于左肝或右肝，左肝内胆管结石较右肝多见。胆管结石分为原发性和继发性两种。
原发性肝内胆管结石
是指原发于胆管系统内的结石，结石的性质大多为含有多量胆红素钙的色素性混合结石，胆囊内一定存在结石。在我国，胆管结石多数属于这一类。
继发性肝内胆管结石
是指胆囊内结石通过扩大的胆囊管进入胆总管而形成的结石，结石的形状和性质多与胆囊内的结石相同，多数呈多面形的胆固醇混合结石。继发于胆道感染的结石的外层带有胆红素钙沉着。
