病毒性脑炎的中医治疗首先应辨别虚实。急性期多实证，主要责之于湿热之邪为患，湿热阻络，治疗宜清热利湿通络；若属寒湿阻滞，治疗宜祛寒湿、温脾肾。恢复期多属虚证，主要责之于脾胃虚弱，治疗宜健脾益气；或肝肾阴虚，治疗应滋补肝肾。
1、痰热壅盛
证候：高热不退，头痛剧烈，恶心呕吐，神识不清，或谵语妄动，喉中痰鸣，唇干渴饮，颈项强直，烦躁不安，四肢抽搐，舌质红绛，舌苔黄腻，脉数或滑数。
治法：泻火涤痰。
方药：清瘟败毒饮加减。
2、痰蒙清窍
证候：起病稍缓，表情淡漠，目光呆滞，喃喃自语，神识模糊，或见痴呆，语言不利，或见失语，口角流涎，喉间痰鸣，纳差乏力，舌质胖嫩，舌苔白，脉弦滑。
治法：涤痰开窍。
方药：涤痰汤加减。
3、痰瘀阻络
证候：神识不明，肢体不用，僵硬强直，或震颤抖动，肌肉萎软，或见面瘫、斜视，舌紫暗或有瘀点，舌苔薄白，脉弦滑。
治法：涤痰通络，活血化瘀。
方药：指迷茯苓丸合桃红四物汤加减。
