1、对消化系统的影响
容易使肠道功能下降，并发小儿营养不良等疾病。
2、对生长发育的影响
小儿处于生长发育的高峰期，相对比成人需要更多的各种营养素供给。因为长期摄入的营养素不足，供不应求，不仅会影响小儿的正常生长发育，严重时使生长发育停滞，体内脏器萎缩，体重不增，个儿不长，甚至引起发育障碍等。
3、对免疫系统的影响
小儿厌食除了影响生长发育情况之外，还会影响小儿的正常免疫系统。由于厌食导致的严重的蛋白质--热能不足，可出现细胞免疫功能紊乱和血清抗体减少，因而容易发生各种细菌、病毒和真菌等感染。可能有反复感冒、发烧，或反复咳嗽、不吃、不好动等表现。
