并发症多见，大部分与原有的多种基础疾病有关，年轻人以及体质好的病人并发症少。老年以及体质低下，特别是重症病人(带有气管插管、呼吸机辅助呼吸的病人)并发症较严重可有：休克、败血症、脓毒血症、心律失常、水电解质紊乱、酸碱失衡、呼吸衰竭、心力衰竭、多器官功能性衰竭等，严重还可并发心肌脓肿。并发症出现后，病情重，进展快，死亡率高。故一旦确诊厌氧菌感染应进行积极的治疗。
