20世纪60年代至80年代，许多医学研究者提倡用长期连续用药预防，主要用药为苯巴比妥，少数人用丙戊酸钠。20世纪90年代以来，由于随访资料证明，大多数该病患儿呈良性经过，出现癫痫发作或者神经发育异常的比例极低；反之，长期应用苯巴比妥预防可以导致一些患儿精神发育和行为异常，以及困倦、睡眠障碍、攻击行为、多动或者注意力不集中等不良反应。而长期服用丙戊酸钠，除了可导致患儿出现行为异常外，还可能导致严重的肝脏损害。2000年尼氏儿科学第16版已经不再推荐用苯巴比妥长期预防用药，提出可以用安定短程给药预防。当然并不是说，长期用药已经淘汰，不同国家的专家提出一些使用的指征。
1998年提出，如果出现以下任何三项，要主张长期用药：
(1)发热前已有神经系统异常；
(2)15~20分钟长程发作者；
(3)呈部分性发作或者伴有泛化者；
(4)父母或同胞有无热惊厥或者癫痫者；
(5)初发年龄6岁；
(6)24小时内复发2~3次者；
(7)发热前体温不足37.5℃；
(8)单纯热性惊厥1年反复发作4~5次以上；
(9)脑电图有特异性痫波发放者。
1999年提出：
(1)已有2次或者更多次低热发作史者；
(2)每次发作有15~20分钟的长程发作史或者间歇投药无效者。
2001年专家提出；
(1)发热前已有中枢神经系异常；
(2)低热即可以引起发作而且反复发作；
(3)复杂部分性发作且呈长程发作者；
(4)间歇投药预防失败或者实施困难；
(5)已查出有热性惊厥有关基因者。
