除了因动脉瘤等需要立即手术或介入治疗的因素所致的肠系膜上动脉压迫综合征外，急性发作期应首先采用保守治疗，给予禁食、胃肠减压、维持水、电解质和酸碱平衡及营养支持治疗，必要时采用完全胃肠外营养。可酌情应用阿托品、山莨菪碱等解痉药物及抑酸剂控制消化道症状。
对因久病而产生焦虑、抑郁的患者酌情使用抗抑郁药(帕罗西汀)，可改善患者临床症状,提高生活质量。症状缓解后,可逐渐给予多次少量流质饮食，餐后使用体位疗法,取侧卧位、俯卧位或胸膝位并将床脚抬高。
如无症状复发,可逐渐增加饮食,减少餐数，下床活动时可使用围腰或腹带防止内脏下垂；改善营养，加强腹肌锻炼，校正脊柱前凸。患者营养状况改善后，肠系膜上动脉和腹主动脉之间夹角脂肪组织填充、角度增大，可使病情长期缓解或治愈。
