肠系膜上动脉压迫综合征的并发症包括急性胃扩张、肠坏死、十二指肠穿孔、上消化道大出血、门静脉血栓等。
1.急性胃扩张：急性胃扩张是指短期内由于大量气体和液体积聚，胃和十二指肠上段的高度扩张而致的一种综合征。通常为某些内外科疾病或麻醉手术的严重并发症。
2.肠坏死：肠坏死又称为急性出血性坏死性肠炎，可以由许多原因导致肠坏死，一旦发生肠坏死将会有腹痛、便血、恶心呕吐等症状。恶心呕吐常与腹痛、腹泻同时发生。呕吐物可为黄水样，咖啡样或血水样，亦可呕吐胆汁。
3.十二指肠穿孔：十二指肠穿孔的局部表现是位于十二指肠壁的局限性圆形，或者是椭圆形缺损，其主要的临床表现为上腹部疼痛、嗳气、反酸等，容易反复发作，而且呈现出慢性经过。
4.上消化道大出血：上消化道大出血的临床表现为大量呕血或便血；在成人，如果一次出血量在800ml以上，占总循环血量的20％，即可出现休克体征。
5.门静脉血栓：门静脉血栓形成可导致肝硬化或节段性萎缩，若同时合并肠系膜静脉血栓形成则可急性致死。约三分之一患者门脉血栓形成缓慢，可形成侧支循环，而且门静脉可再通，但最终仍进展为门脉高压。
