应与下列疾病进行鉴别：
1、原发性免疫缺陷病。
2、继发性免疫缺陷病，皮质激素，化疗，放疗后引起或恶性肿瘤等继发免疫疾病。
3、特发性CD4T淋巴细胞减少症，酷似AIDS，但无HIV感染。
4、自身免疫性疾病结缔组织病，血液病等，AIDS有发热、消瘦则需与上述疾病鉴别。
5、淋巴结肿大疾病如KS，霍奇金病，淋巴瘤，血液病。
6、假性艾滋病综合征AIDS恐怖症，英国同性恋中见到一些与艾滋病早期症状类似的神经症状群。
7、中枢神经系统疾病脑损害可以是艾滋病或其他原因引起的，需予鉴别。
8、与肾病综合征或其他肾脏病引起FSGS进行鉴别HIV肾病的FSGS病理特征有助于与其他肾脏病鉴别，但仍缺乏特异性，尤其是与二醋吗啡肾病(HAN)的病理特征十分相似，应认真加以鉴别。
