皮肤囊肿青年时期多发，常由于皮肤外伤所致，有时发病与外伤间隔多年或者伤情稍微而难以回忆。皮肤囊肿种类很多，其病因也不相同。 1、多发性脂囊瘤为常染色体显性遗传。 2、皮样囊肿为先天性，生后即有。 3、支气管源性与甲状腺舌骨导管囊肿为先天发育不良异常所致。 4、阴茎中线囊肿为先天发育异常所致。 5、发疹性炭毛囊肿病因不清，有的报告认为属常染色体显性遗传。
