良性纤维组织细胞瘤无特殊并发症，但由于骨骼细胞被破坏，故可造成骨骼的脆性增加，甚至并发病理性的骨折，临床上应引起重视。由于本病有骨骼的破坏，当破坏到骨皮质时患者会感有明显的疼痛，疼痛可以影响到睡眠以及情绪抑郁。但本病属于良性特征，并发症均较少见。
