蓝氏贾第鞭毛虫分类学属于肉足鞭毛门，动鞭毛纲，六鞭虫科，双滴虫目，贾第属。该属下除有寄生在人体的蓝氏贾第鞭毛虫（G.lamblia）外，还有寄生在哺乳动物、鸟类、两栖动物体内的多种贾第鞭毛虫，如牛贾第虫（G.bovis）、马贾第虫（G.egui）、鼠贾第虫（G.muris）等。滋养体寄生在小肠，尤其以十二指肠最多，胆囊、肝脏、胰等均可发现。病当虫体寄生在胆道系统时，可能引起胆囊炎或胆管炎。如出现上腹疼痛、食欲不振、肝肿大以及脂肪代谢障碍等。
一般认为蓝氏贾第鞭毛虫病发病情况与虫株毒力、机体免疫状况和共生内环境等多方面因素有关。滋养体以吸盘吸附在肠黏膜表面，造成机械性刺激与损伤导致黏膜炎症。虫体大量繁殖时，可大片覆盖肠黏膜，影响脂肪及脂溶性维生素等物质的吸收，虫体还与宿主竞争腔内营养，肠内菌群的改变，在不同程度上可使肠功能失常。虫体可引起小肠微绒毛病变并导致乳糖酶与木糖酶等双糖酶的缺乏，产生腹胀及乳糖耐受性差等症状。
