1、组织病理学检查病变脑组织可见海绵状空泡、淀粉样斑块、神经细胞丢失伴胶质细胞增生，极少白细胞浸润等炎症反应。2、免疫学检查多种免疫学方法，如免疫组织化学、免疫印记、酶联免疫吸附试验等，以用于检测组织中的PrPsc。采用抗PRP27―30抗体，可在经异硫氰酸胍及压热处理或蛋白酶K消化溶解PrPc后的病变组织检测到PrPsc。单克隆抗体15B3仅能结合PrPsc，因此不需经溶解PrPc的处理即可识别PrPc和PrPsc。取材包括脑、脊髓、扁桃体、脾、淋巴结、视网膜、眼结膜及胸腺等多种组织。应用免疫印记方法，尚可在脑脊液中检测到一种较具特征性的脑蛋白14―3―3，该蛋白是一种能维持其他蛋白构型稳定的神经元蛋白，正常脑组织中含量丰富但并不出现于脑脊液中，当感染朊毒体时大量脑组织破坏，使脑蛋白14―3―3泄露于脑脊液中。3、动物接种试验将可疑组织匀浆或口服接种于动物（常用老鼠、羊等），观察被接种动物的发病情况，发病后去其脑组织活检具朊毒体病的特征性病理改变。此法敏感性受种属间屏障限制，且需时较久。4、物理检查脑电图检查可有特征性的周期性尖锐复合波，具辅助诊断价值。此外，计算机断层扫描（CT）及磁共振成像（MRI）的脑影像学检查，可资鉴别朊毒体病变与其他中枢神经系统疾病。5、分析生物学检查从患者外围血白细胞提取DNA，对PRNP进行PR扩增及序列测定，可发现家族遗传性朊毒体病的PRNP性突变诊断：朊毒体病的确诊需依赖脑组织的病理检查，因此生前诊断较为困难。（1）流行病学资料进食过疯牛病可疑动物来源的食品，接受过来自可能感染朊毒体供体的器官移植或可能被朊毒体污染的电极植入手术，使用过器官来源的人体激素以及有朊毒体病家族史，均有助本病诊断。（2）临床表现虽然毒体病大多表现为渐进性的痴呆、共济失调及肌阵挛等，但不同的朊毒体病也有各自的特点如散发性克―雅病发病年龄较大，多先有痴呆后有共济失调，而新变异型克―雅病发病年龄较轻；库鲁病震颤显著，往往先有共济失调后出现痴呆；杰茨曼―斯脱斯勒―史茵克综合征多仅有共济失调等小脑受损表现少见痴呆；致死性家族性失眠症以进行性加重的顽固失眠为特着。（3）实验室检查脑组织的海绵样病理改变及PrPsc阳性的免疫学检测确诊本病有重要意义。脑脊液中的脑蛋白14―3―3及脑电图PSWCs具有辅助诊断价值。PRNP序列碱基突变的遗传学分析则有助家族性朊毒体病的诊断。预后极差，以知病例无一例外均告死亡。
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