临床上常见到诊断为慢性盆腔炎的患者经长期抗炎治疗效果不显著，实际为子宫内膜异位症或其它疾病。因此，临床医师在工作中应深入了解病情，综合考虑诊断及鉴别诊断，特别注意与子宫内膜异位症进行鉴别。
慢性盆腔炎发病率较高，若多次充分治疗无效应与子宫内膜异位症相鉴别。二者均具有广泛粘连、痛经、不孕及月经改变等表现。但慢性盆腔炎患者痛经可随炎症逐渐减轻而好转或消失。子宫内膜异位症患者痛经明显且呈进行性加重趋势。子宫内膜异位症患者体格检查时可发现子宫峡部和子宫直肠窝有不规则结节，触痛明显;形成内膜异位囊肿时，在附件区可扪及活动度差的囊块，B超可见囊壁粗糙，囊肿内回声为液性暗区，伴稀疏光点。腹腔镜下可见子宫直肠窝、宫骶韧带及卵巢上典型的蓝黑色、棕黑色结节或卵巢巧克力囊肿等病灶而确诊子宫内膜异位症。而慢性盆腔炎患者不显示这些病症，应谨慎加以区分。
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