流脑疫情的处理包括散发以及局部暴发或流行时疫情的处理。
一散发疫情的处理
1在采取上述措施的基础上认真做好流脑病人就地隔离治疗。如果当地确实不具备抢救条件须转诊时，也一定要在转衣前采取紧急措施并派医务人员护送。2认真做好患者周围疑有流脑表现的病人的诊治，在患者周围人群（同家、同院、同班、同托儿所、同玩以及其他经常密切接触的成年人）中调查，若发现上感样的病人，应按轻度流脑患者处理，给磺胺药物或其他抗菌药物治疗2-3天，并注意观察病情，一旦病情转重，立即采样检验进行确诊并及时给予相应的治疗。
3若疫情发生在未实施A群脑膜炎双球菌多糖菌苗免疫的地方或发生在只对幼儿进行了免疫的地区，须对病人周围人群中15岁以下未免疫的儿童应急接种上述菌苗（有菌苗接种禁忌症者除外）。
4在处理疫情时，需及时采取病人标本，分离培养流脑或检测抗原或测定急性期与恢复期血清抗体，进行血清学诊断。若发现不是A群流脑而是B群或其他群流脑引起发病时，注射上述菌苗无预防作用，应对病人周围密切接触的人群进行药物预防。
5抗菌药物预防首选SD等磺胺药物，若预防效果不佳可酌情使用利福平。5.1SD：成人每天4-6g,儿童用量为0.1g/（kg・d），分两次口服，首剂加倍。连服3-5天，均同时服用等量苏打。5.2磺胺异恶唑（SIZ）：成人4-6g/d，儿童用量为0.1-0.2g/(kg・d)，分4次口服，首剂加倍，连服3-5天。5.3利福平：成人每12h600mg，儿童每12h10mg/kg，服用2天。
二局部暴发或地区流行时疫情的处理1对流脑病人和在病人周围人群中所发现的上感样病人的处理同2.1.1.和2.1.2。2若暴发或流行发生在未实施菌苗免疫的地区或发生在只对幼儿进行了免疫的地区，除了对暴发或流行范围内90%以上15岁以下儿童应给予应急接种菌苗外，还必须对病人同家、同院、同厂矿与工地、同兵营以及经常密切接触病人的其他成年人酌情应急注射菌苗。2.2.3同2.1.4一样进行检查，以确定引起暴发或流行的流脑血清群。一旦发现它不是A群而是B群或其他群流脑时必须同上述一样对病人周围密切接触的人群进行抗菌药物预防。
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