黄体功能不全患者容易发生流产，导致流产的可能原因如下：
孕激素不足
孕激素的主要作用是利于胚胎着床，防止子宫收缩。如果怀孕初期孕激素偏低会干扰早期胚胎发育，是造成流产的主要原因。
雌二醇不足
在子宫内膜增生期，由于卵泡分泌雌二醇不足，致使子宫内膜发育迟缓。排卵后，由于卵泡发育而来的黄体分泌雌二醇的功能仍末得到改善，使孕激素不能充分作用于子宫内膜，更加重了子宫内膜发育不良，致使胚胎着床受到障碍而致流产。
激素受体不足
研究发现，反复性早期流产患者增生期子宫内膜的雌激素受体含量或分泌期子宫内膜的孕激素受体含量均明显偏低。激素是通过受体发挥作用，激素和受体任何一方面减低或功能异常均会导致激素效应的减低，即子宫内膜发育异常。
卵泡刺激素不足
黄体功能不全患者的月经周期中常可发现卵泡刺激素水平偏低，导致卵泡成熟不充分，即使足量的黄体生成素也不能使黄体功能正常，造成黄体缺陷，因此卵泡刺激素偏低是黄体功能不全患者流产的重要原因。
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