有人认为三叉神经痛就是一种偶发性的疾病，其实这种认识是不对的，因为三叉神经痛患者的疼痛往往是反复出现的，并不是偶然的。患者以及健康人都需要了解三叉神经痛的原因，加深对疾病的了解和认识。
其实三叉神经痛的具体病因是相当复杂的，人们进行了长时间的研究也并未最终明确。现在人们提出比较多的是中枢病因学说：三叉神经系统中枢部的脑内核团，三叉神经脊束核丘脑及大脑皮质均可因周围病变刺激及中枢本身的伤害性刺激。周围病原学说：三叉神经末梢到脑干核团的任何部位发生病变都可刺激三叉神经，使中枢神经系统发生生理功能紊乱和器质性改变，从而发生三叉神经分布区范围内的阵发性剧痛性的学说。
还有的专家认为三叉神经痛多是由于病毒感染造成的，这种看法可以被称之为病毒感染学说：大脑皮质是周身感觉的最高中枢，早有定论，对三叉神经系统任何部位的病灶所致的疼痛，均是通过大脑皮质反映出来的。如疱疹和单纯疱疹的病毒感染，可沿三叉神经系统的通路而侵入三叉神经分布相应的大脑皮质。
由此可见，三叉神经痛的原因现在并未明确，但是这并不妨碍人们进行疾病的治疗和预防。所以得了此病的患者要积极加以治疗，是可以控制病情的。而也可以根据这些病因来进行疾病的预防，防止得病。
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