诊断：此病的诊断主要根据上下呼吸道的坏死性肉芽肿性血管炎局灶性坏死性肾小球肾炎和累及动脉和静脉的全身性坏死性血管炎对出现眼球突出、坏死性巩膜炎周边角膜溃疡和多种类型的葡萄膜炎患者应详细询问呼吸道、肾脏病等病史，如发现黏膜溃疡、腭部溃疡和破坏性鼻窦炎则对诊断有很大帮助
有关此病的诊断标准，主要基于此病的三联症即上、下呼吸道的坏死性肉芽肿、全身性血管炎和局灶性坏死性肾小球肾炎如患者具有3种表现则称为完全型，如缺少1种或2种表现则被称为不完全型。鉴别诊断：wegner肉芽肿应与能够引起血管炎呼吸道炎症、肾小球肾炎的全身性疾病相鉴别，对出现葡萄膜炎和(或)巩膜炎者则主要应与类肉瘤病性葡萄膜炎和复发性多发性软骨炎及其伴发的葡萄膜炎相鉴别
1.类肉瘤病可引起肺部病变、葡萄膜炎和巩膜炎但它所致的肺部病变主要表现为肺门淋巴结肿大，除引起多种类型的葡萄膜炎和巩膜炎外，常引起结膜结节泪腺肿大易引起淋巴结病，患者血管紧张素转化酶水平通常升高，根据这些特点一般不难将二者鉴别开来
2.复发性多发性软骨炎也可引起鼻软骨改变马鞍状鼻畸形、葡萄膜炎和巩膜炎，但此种疾病还易引起耳廓软骨喉、气管软骨的改变，一般没有上下呼吸道的坏死性肉芽肿，这些特点都有助于二者的鉴别。
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