甲肝病毒感染和乙肝病毒感染同时发生，称混合感染。在慢性乙型肝炎或乙肝表面抗原携带者基础上，又发生甲肝病毒感染，称重叠感染。两者难辨明者，统称双重感染。在一些乙肝表面抗原慢性携带率高的地区，甲肝病毒与乙肝病毒的双重感染相当常见。
乙肝表面抗原携带者重叠感染甲肝病毒约占2.8%，甲、乙两型肝炎同时感染的约占1.1%。1996年四平市传染病院对1400例住院病毒性肝炎中的92例重叠感染的病例进行分析，发现甲肝病毒、乙肝病毒重叠感染者26例占1.86%（26/1400）。而武汉报道268例急性肝炎病人中甲肝病毒、乙肝病毒双重感染者达86例，其发生率为32%。资料表明，地区不同，统计范畴不同（社会，住院者，病种范围不同），其发生率差异很大。
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