根据本病的临床表现特点和组织学改变的特征，并结合内镜等检查常可做出诊断。一般认为当具有下列情况时应考虑为SRUS：①临床以血便、黏液便、排粪障碍及肛门疼痛等为主要表现；②内镜检查可见直肠前壁或前侧壁黏膜有局限性糜烂或溃疡；③病理学检查结果符合前述本征组织学改变的基本特征。
由于本征患者直肠固有膜内平滑肌及纤维结缔组织围绕肠腺生长，腺体细胞具有一定的异型性，腺体大小不一，加之内镜活检取材组织较小并有破碎，故易与肠癌混淆。当腺体增生反应明显时，易与腺瘤混淆。应注意鉴别诊断。当SRUS合并痔疮时与单纯痔疮不易区别，两者的区别点在于痔核硬化结节间可见残留的痔性扩张血管，血管周围纤维化明显，黏膜下层纤维组织中的平滑肌增生不明显；而SRUS是在黏膜层腺体间及黏膜肌层纤维组织增生。
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