（一）药物治疗男生殖系结核用抗结核药治疗有较好的效果前列腺及精囊结核均可用药物保守治疗。药物治疗的方法与肾结核相同，采用以异烟肼链霉素、利福平等为主的两种或三种药联合应用。应用的疗程一般经验为6～12个月
（二）手术治疗男生殖系结核的手术治疗主要解决生殖系的附睾结核附睾结核的解决有助于生殖系其他部位结核（精囊、前列腺）的愈合。手术在附睾病变局限后施行与肾结核相同在手术前后亦需要给抗结核药物。
附睾切除的适应证：
1．一侧附睾结核
2．一侧附睾冷脓疡形成
3．双侧附睾冷脓疡形成
4．一侧附睾阴囊慢性窦道形成
5．双侧附睾阴囊慢性窦道形成
附睾切除时输精管的切端应尽量高位切断，并移植于皮下，以免缩回预防残留的输精管内结核病变在阴囊内形成结核性脓疡。在切除附睾时，睾丸应尽量保留如睾丸已有病变累及，则将病变部分的睾丸一起切除，以保留部分的睾丸功能；若病变已累及大部分睾丸睾丸无法保留时，则可将睾丸一并切除。
对附睾切除时对侧输精管的处理意见尚不一致对术前精液常规检查已无精子者，以将对侧输精管结扎为宜。
