先天性直肠肛门畸形分类新法：（一）男性1．高位畸形（1）肛门直肠发育不全：①直肠前列腺尿道瘘：瘘管开口于后尿道，无肛门内括约肌、外括约肌不明显，盲端位于PC线上。②无瘘：盲端与尿道间可有纤维索带连接，无肛门内括约肌，仅有外括约肌痕迹，盲端平或高于PC线。（2）直肠闭锁：直肠盲端止于不同高度，肛门及肛管正常，有肛门内、外括约肌及提肛肌，且与肛管保持正常关系。
2．中间位畸形（1）直肠尿道球部瘘：直肠盲端位于尿道球部海绵体肌之上，耻骨直肠肌包绕直肠盲端瘘口、肛门内括约肌缺如，直肠盲端位于PC线与I线之间。（2）肛门发育不全、无瘘：直肠盲端终于尿道球部海绵体肌之上，耻骨直肠肌环绕直肠盲端。肛门内括约肌缺如，外括约肌仅见痕迹，直肠盲端位于PC线与I线之间。
3．低位畸形（1）肛门皮肤瘘：瘘管开口于肛门至尿道背部正中线上的任何部位，以阴囊部居多。肛管呈瓣状，瘘管被菲薄的皮肤缝掩盖。耻骨直肠肌正常。（2）肛门狭窄：肛门及内、外括约肌正常。
4．罕见畸形。
（二）先天性直肠肛门畸形分类-女性1．高位畸形（1）肛门直肠发育不全：①直肠阴道瘘：直肠盲端开口于阴道后壁中部。②无瘘。（2）直肠闭锁。
2．中间位畸形（1）直肠前庭瘘：直肠盲端位于PC线上或稍下，瘘管长1～2cm，通过耻骨直肠肌，沿阴道后壁开口于阴道前庭窝。（2）直肠阴道瘘：瘘管开口于处女膜上方，耻骨直肠肌环绕直肠盲端与瘘管。（3）肛门发育不全、无瘘：直肠盲端终于阴道下端平面，尿道及阴道正常。直肠盲端位于I线或其下。
3．低位畸形（1）肛门前庭瘘：瘘管甚短，直肠与阴道紧密相邻。耻骨直肠肌正常，有肛门内括约肌痕迹。肛门外括约肌有时存在，瘘口位于阴道前庭部，瘘口周围为粘膜。（2）肛门皮肤瘘。（3）肛门狭窄。
4．泄殖腔畸形5．罕见畸形
