新生儿肝炎主要是由于病毒引起的，病毒多种多样如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒、风疹病毒、单纯疱疹病毒及肠道病毒等。弓形体原虫、李司忒菌、梅毒等，亦是本病的病因之一，新生儿肝炎的检查主要有以下几个方面：
胆酸定量测定：弹道闭锁早期叫新生儿肝炎血清中胆酸明显增高，动态监测更有鉴别诊断意义。
低密度血浆脂蛋白-X（Lp-X）测定：在胆道闭锁时，胆汁在肝内淤滞，血清Lp-X则明显升高;新生儿肝炎早期呈阴性。倘若生后1.5个月以上Lp-X仍呈阴性，可排除胆道闭锁的可能。
血清胆红素动态监测：肝炎随治疗病情发展血清胆红素浓度曲线逐渐下降，而胆道闭锁随病情发展血清胆红素浓度曲线则呈持续性升高。但当重型淤胆性肝炎时亦可表现血清胆红素浓度曲线持续上升，此时鉴别有困难。
检测十二指肠引流液中的胆红素量。
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