阴茎癌的临床表现主要视包皮能否翻转而定，包皮过长者的癌变被发现较包茎者为早。在包皮过长者中，早期常在龟头或包皮内板见到丘疹、湿疹、疣、小疱及溃疡等表现，初时很小，尔后逐渐增大，虽经一般治疗而不见好转，有的呈乳头状生长或溃疡经久不愈，更应引起警惕。在包茎者中，由于其包皮口狭小，不易见到病变。起初患者可能仅感包皮内有刺痒不适，或有烧灼、疼痛感觉，或在阴茎头某部能摸及肿块。此时必须和包皮垢相区别。如同时伴有包皮阴茎头炎，由包皮口则常有脓性渗出物流出，或有血性液；分泌物均有恶臭。当肿瘤继续生长，侵及阴茎头的大部时，则能清楚触及肿块，因合并有感染，可使阴茎头部疼痛、排尿不适或尿道疼痛。如肿瘤在包皮囊内占位过多，可使尿道口移位，尿线变形。
如有腹股沟淋巴结转移，该处淋巴结可以增大，随着病情的发展而形成较大的肿块，再晚期可溃破呈溃疡型或菜花状肿块。此时则出现全身症状如消瘦、贫血、食欲不振、恶病质等，终至全身衰竭。因为阴茎癌大多伴有局部炎症，腹股沟淋巴结亦常有炎症，淋巴结因炎症而引起肿大，不要将增大淋巴结都误认为是癌肿转移。
阴茎患者的病程长短不一，平均发病至就诊时间为1~2年，亦有长达数年者。有些病例在作包皮环切时肉眼并未发现肿瘤，仅是伤口经久不愈，尔后不久出现肿瘤。所以，凡作包皮环切者，包皮组织最好送病理检查，以便早期诊断；对年龄较大的作包皮切后需加强随访，因为有些癌肿是在包皮环切后不久即发现的。
