本病确诊需待脑组织病毒分离或免疫荧光检查。目前在我国此项检查尚未能广泛开展情况下，主要依赖临床诊断。诊断依据： (一)病前可有上呼吸道或消化道感染病史; (二)急性或亚急性起病; (三)急性期精神症状以谵妄状态或木僵状态为主症; (四)痉挛发作或神经系统阳性体征; (五)脑电图阳性发现，尤其颞、额部显著; (六)血及脑脊液轻度炎症性反应，疱疹病毒抗体阳性; (七)排除：脑肿瘤、精神分裂症、躁郁症。
