溶血性尿毒症综合征（Hus） 本病多见于4岁以下幼儿，可有血小板减少和微血管病性溶血性贫血，但一般无发热和神经精神症状，主要以肾脏损害为主。血浆中很少有vWF-CP活性的下降。
播散性血管内凝血（DIc） 表现为严重的出血、血小板减少、循环衰竭、栓塞和溶血，而无一过性多变性的神经精神症状，溶血一般较轻。实验室检查可有PT缩短或延长，FDP、D-二聚体增高，抗凝血酶Ⅲ活性降低。
Evans综合征（自身免疫性溶血性贫血合并免疫性血小板减少性紫癫）本病可有血小板减少引起的出血和溶血性贫血，但无神经系统的症状，外周血中也无畸形和破碎的红细胞。抗球蛋白试验（Coombs试验）常阳性。
系统性红斑狼疮（SLE） 可有发热、肾脏损害、精神症状，部分患者可合并溶血性贫血和/或血小板减少性紫癜，但外周血中也无畸形和破碎的红细胞。免疫血清学检查可有抗核抗体和/或双链DNA阳性。
阵发性睡眠性血红蛋白尿症（洲）可有溶血性贫血和血小板减少引起的出血，但无神经系统的症状，外周血中也无畸形和破碎的红细胞。酸溶血试验阳性，CD55、CD59降低。
其他还需与先兆子痫/子痫、HELLP鉴别，前者主要表现为在怀孕后半期新发的高血压和蛋白尿，症状在产后消失，患者常有血小板减少，轻度的溶血；后者主要表现为妊娠后期出现溶血、肝功能异常和血小板减少。
