真菌性角膜炎(fungal keratitis，mycotic keratitis)或角膜真菌病(keratomycosis)，临床上较难诊断，容易误诊，常因治疗不当而造成失明。真菌性角膜炎并非少见。用抗生素治疗无效的所谓“匐行性角膜溃疡”病例中，有很大一部分可能就是真菌感染引起。在发病上，南方多于北方;1年中，夏秋农忙季节发病率高。在年龄与职业上，多见于青壮年、老年及农民。
诊断比较困难，必须与细菌性角膜溃疡进行鉴别。有农业性眼外伤史，典型的临床表现，是诊断的主要依据。再者，疑为真菌感染时，应作角膜病变处刮片。将取下的坏死组织放于玻片上，滴5%氢氧化钾一滴，覆盖破片，立即镜检，寻找真菌菌丝。有条件时应进行真菌培养。
通常需要和细菌性角膜炎、病毒性角膜炎鉴别。
