原发性气管恶性肿瘤大多生长于软骨环与膜部交界处，鳞状上皮细胞癌可呈现为突入气管腔的肿块或溃破形成溃疡，有时癌变可浸润长段气管，晚期病例常有纵隔淋巴结转移或扩散入肺组织，并可直接侵犯食管，喉返神经和喉部，囊性腺样癌一般生长较为缓慢，较晚发生转移，有时呈现长段粘膜下浸润或向纵隔内生长，有的肿瘤呈哑铃状，小部分突入气管腔，大部分位于纵隔内，晚期病例可侵入纵隔和支气管。
原发性气管良性肿瘤种类多，形态不一，在多数肿瘤生长缓慢，表面光滑，粘膜完整，常有瘤蒂，不发生转移，但如切除不彻底易复发，乳头状瘤多发生于气管膜部，突入气管腔底部，常有细蒂，大小自数毫米至2cm，有时为多发性，表面呈疣 状，质软而脆易脱落，破裂时出血。