(一)发病原因
由于先天发育异常，胚胎早期消化道空化过程异常所致，隔膜多位于幽门前1.5～3cm处，或接近幽门处，也有时同时发生两个，另一个距幽门数厘米处远在十二指肠，将胃和十二指肠分隔开，隔膜中央多有孔，孔的直径为3～10cm，如无孔则引起胃内部梗阻和闭锁，横膈厚2～3mm，由黏膜，黏膜下组织和肌层组成，隔膜两侧均被覆有黏膜，间隙中充满疏松结缔组织，孔位于中央或稍偏，虽无肌纤维，但保持扩张状态。
(二)发病机制
隔膜多位于幽门前1.5～3cm处或接近幽门处，也可有两个隔膜，另一个在幽门远端数厘米处，隔膜上常有孔，直径1～3cm，隔膜厚2～3mm，由黏膜，黏膜下层和肌层组成，如无孔则出现胃内梗阻和闭锁。