疾病因素（75%）：
输卵管畸形的原因很多，虽然可以由输卵管发育不良，输卵管内的子宫内膜移位症或输卵管内有息肉所造成，最主要的原因还是由于输卵管炎症所引起，常见的炎症有两种：一种是化脓性输卵管畸形，多数是因为分娩，流产或手术后发生炎症而引起，也可因为邻近脏器的炎症引起，如阑尾炎，腹膜炎。另一种是结核性输卵管畸形，大多是因为肺结核和腹膜结核播散而来。
生理因素（15%）：
输卵管先天性畸形不易被发现，原因首先是常与生殖道先天畸形同时存在而被忽略，其二是深藏在盆腔侧方。常用的诊断方法，子宫输卵管造影术后发现单角子宫单侧输卵管或双输卵管。