感染因素（25%）：
感染所导致的肾绞痛，最常见的致病菌为金黄色葡萄球菌，细菌可以由其他部位化脓病灶经血液进进肾脏、例如疖、痛、脓肿、感染伤口、上呼吸道感染、及肾邻近组织感染等。初期病变局限于肾皮质形成多发微小脓肿，继之可集合成多房性脓肿，部分病人可由小脓肿融合成大脓肿，成为肾绞痛，少数病人到晚期，近皮质肾绞痛可穿破包膜，发展成为肾周脓肿，近肾盏的脓肿可穿孔向肾盂引流，则尿中可找到细菌。
其它原因（20%）：
如囊肿、结石等也可以引起肾绞痛，通常输尿管结石会让人感到剧烈的疼痛;肾囊肿及各种类型的肾炎由于肾间质受损也会引起肾绞痛;长时间采取坐姿或走了很长时间的路之后也会感到肾部发酸、发胀似的疼痛。
肾结石（40%）：
肾绞痛，最常见的原因是患有肾结石。其次是肾囊肿和各种类型的肾炎。患者假如出现这样的情况，可以先到医院检查一下肾脏B超，看有无肾结石、囊肿之类的疾病，再检查一下尿常规，看有无肾脏病。若检查都正常的话，那可以看中医治疗，可能是肾虚腰痛或者是冷湿腰痛。