病因：
间质性膀胱炎、局限性外阴炎和脱屑性阴道炎 综合征与多个性伙伴、念珠菌感染、解脲支原体感染 有关，或是感染后的后遗症。局限性外阴炎和间质性膀胱炎所涉及的组织，包括均起源于胚胎生殖窦的膀胱、尿道和前庭组织，这种非感染性炎症综合征可能与自动免疫原因有关。
发病机制：
间质性膀胱炎、局限性外阴炎和脱屑性阴道炎综合征患者膀胱黏膜变薄，显微镜下可见溃疡，表皮下层有水肿 、充血、毛细血管扩张和血管周围间质出血，有淋巴细胞浸润，也能见到肥大细胞和嗜伊红细胞，疼痛是与持续性或仅在膀胱充血、膀胱排空后或膀胱受到冲击时如性交期间出现，病程较长或较老年妇女膀胱可萎缩变小和有明显的溃疡。