预防方法
乙脑的预防主要采取两个方面的措施，即灭蚊防蚊和预防接种。
三带喙库蚊是一种野生蚊种，主要孳生于稻田和其它浅地面积水中。成蚊活动范围较广，在野外栖息，偏嗜畜血。因此，灭蚊时应根据三带喙库蚊的生态学特点采取相应的措施。如：结合农业生产，可采取稻田养鱼或洒药等措施，重点控制稻田蚊虫孽生；在畜圈内喷洒杀虫剂等。
预防药物
蚊虫控制措施难以全面落实的情况下，疫苗接种成为控制乙脑流行最为有效的方法。目前，国内外应用的乙脑疫苗主要有灭活疫苗和减毒活疫苗两种。
灭活疫苗主要是鼠脑纯化灭活疫苗和地鼠肾细胞灭活疫苗。鼠脑纯化灭活疫苗是从感染鼠脑培养制备的，由日本研制生产并得到国际广泛认可和使用的疫苗。地鼠肾细胞灭活疫苗为我国生产，病毒经原代地鼠肾细胞培养制备的疫苗，1998年开始生产使用，随后在全国大面积使用。近年来，Vero细胞纯化灭活疫苗已在研究生产，这是新一代的乙脑灭活疫苗，有较好发展前景。
减毒活疫苗是我国自主研制的乙脑SA14-14-2株，为目前唯一获得认可和推广使用的乙脑活疫苗，自1989年获得新药证书以来，该疫苗产量不断增多并在全国广泛使用达3亿多人份。该疫苗具有接种针次少，副反应小，免疫原性高、免疫效果好等优点而在国内得到广泛应用，并出口到韩国、尼泊尔和印度等国家。
疫苗注射的对象主要为流行区6个月以上10岁以下的儿童。在流行前1个月开始，首次皮下注射，（6～12个月每次0.25ml，1～6岁每次0.5ml，7～15岁每次1ml，16岁以上每次2ml）间隔7～10天复种1次，以后每年加强注射一次。预防接种后2～3周体内产生保护性抗体，一般能维持4～6个月。
