⑴慢性炎症的存在使巴氏腺导管阻塞，分泌物排出不畅，以致腺体囊性扩张，形成囊肿。 ⑵急性巴氏腺炎症消退后，如腺管仍阻塞，分泌物不能排出，脓液被吸收，液体逐渐转清，即形成巴氏腺囊肿。 ⑶分娩时阴道及会阴外侧裂伤，形成瘢痕，或不正确的会阴侧切损伤巴氏腺导管，使巴氏腺管口闭塞，分泌物潴留，也会引起巴氏腺囊肿。 ⑷先天性巴氏腺导管狭窄，或分泌物粘稠，巴氏腺液排出不畅，同样能导致囊肿形成。
