可以引起肛瘘的病因其实也是比较多的，现在来说，最常见的就是各种感染因素，感染的途径不单一，最常见的就是细菌直接感染，以及邻近器官炎症的蔓延，比如，肛周脓肿就是其中之一。下面，就导致肛瘘的常见因素总结如下：
①有肛肠疾病的发展而引起的，肛周脓肿的就是常见的一种导致肛瘘的原因之一，由于患者的日常排便有问题，就会导致粪便滞留肛隐窝，引起肛腺炎，导致肛周脓肿，患者常不予以重视，肛周脓肿破溃后，脓液排出，脓腔逐渐缩小，外部破溃口和切口也缩小，腔壁形成结缔组织增生的坚硬管道壁，即成瘘管，肛瘘由此形成。
②结核杆菌、放线菌等感染所形成的脓肿，克隆氏病等难以自愈而形成特殊性肛瘘。
③直肠肛门损伤、外伤。上海中佑肛肠医院专家强调：来自消化道的骨性异物、金属、肛表及肛门窥器检查损伤肛管直肠，细菌侵入伤口即可引起肛周脓肿，不及时治疗，都可导致肛瘘。
肛门部位的卫生是非常关键的，要知道的是，肛门部位皮肤组织比较特殊，最容易藏污纳垢，在夏季，也可以说是人体细菌集中最多的部位之一，若是身体免疫力较差，以及不重视卫生的话，就可以引起肛瘘的发病。
