肛提肌综合症典型的临床表现为严重的、阵发性肛门疼或尾骨痛，经常心烦的直肠内不适，疼痛的部位常常位于肛门内或肛周区域、多数人常从睡眠中疼醒，有的排便时疼痛加剧，持续时间约几秒钟至数小时，多数病人久蹲症状加剧。
