急性坏死出血性脑脊髓炎重症病例可能会继发肺部感染、尿路感染、褥疮等。若治疗延误会发生永久性的神经支配区功能障碍，而且复发和迟发神经再度受损会导致病情进一步加重，严重时可迟发缺血性脑萎缩或其他更严重的并发症。
