绝经与阿尔茨海默病综合征主要是因妇女绝经后，体内雌激素水平大大降低，也就丧失了对脑结构的营养作用，更容易得阿尔茨海默病。雌激素对脑结构功能的影响涉及神经细胞、血管结构、神经递质三个方面：
1、神经细胞
雌激素有神经营养作用。胎鼠海马、基底前脑、大脑皮质神经元的体外培养研究显示小剂量结合雌激素能促进神经细胞轴突、树突的生长，突触的形成。雌激素还能促进星状神经胶质细胞发育，支持神经元功能。
2、血管结构
雌激素有扩张血管、改善脑的血液供给的作用。采用单光子发射计算机扫描(SPECT)或正电子发射断层显像(PET)测定区域性脑血流(rCBF)的研究，有报道绝经后妇女rCBF低，尤其在潮热发作时。ERT改善rCBF约增加22％，尤其是颞叶、海马区。雌激素促进一氧化氮(NO)合成酶的表达，降低IL-1的活性、阻断IL-6的生成，从而减少β淀粉样蛋白所引起的炎性反应。
3、神经递质
雌激素对多种神经递质的合成有促进作用。科学家对去卵巢大鼠注射雌二醇后，发现基底前脑核及其投射区的胆碱乙酰基转移酶(合成乙酰胆碱所必须的酶)活性增加，而且呈量效关系；雌激素拮抗剂能阻断此作用。雌激素也有降低单胺氧化酶(MAO)活性、增加脑内单胺类神经元，5-羟色胺神经元受体的作用。雌激素可能有抗抑郁焦虑作用，从而提高患者的积极性。
