肝脓肿主要可产生三类并发症，即血源播散、继发细菌感染及脓肿穿破。多数病例表现逐渐消瘦、体重减轻、乏力、呈现恶病体质。晚期病例可因门脉受压而有消化道出血、腹水以及肝功能衰竭表现。脓肿胆总管梗阻可引起多发性肝脓肿，在发生肿瘤的胆囊腔内或其周围形成脓肿是常见的。
