非典型麻疹综合征本病暂无有效预防措施，早发现早诊断是本病防治的关键，同时应尽量避免还在在生病期间去接种麻疹疫苗，这时可因患儿抵抗力低下，容易造成麻疹减毒活疫苗的感染，而出现非典型麻疹综合征。其次应避免与麻疹患儿接触，抵抗力强的患儿有轻微的麻疹感染，也可以导致非典型麻疹的发生。
