病因至今未完全明了，可能系一种变态反应。有人认为与C型产气荚膜梭状芽胞杆菌有关，它产生的β肠毒素可使组织坏死，并作用于肠管血管，使之发生痉挛和血管内凝血，导致粘膜和粘膜下层水肿、出血、坏死。细菌内毒素血症可以引起非特异性超敏现象，导致血管病变，渗出和血管内凝血而发生本病。亦有人认为过多食入含有胰蛋白酶抑制物(如花生、大豆、蚕豆及甘薯等)时，使胰蛋白酶活性降低，减弱了胰蛋白酶对细菌所产生毒素的分解与破坏能力，因而致病。某些患儿合并肠蛔虫症，蛔虫可分泌胰蛋白酶抑制物质，可能是诱发本病的因素。
