由于急性尿道炎症状轻微不影响正常生活，感觉急性尿道炎是小毛病，这样时间一久，就变成慢性尿道炎了。这时就会出现许多并发症。
如男性可并发睾丸炎、附睾炎、前列腺炎、精囊腺炎、附睾结节、输卵管梗阻，精子数量质量都降低，阳萎、早泄、男性不育等；女性可并发阴道炎、宫颈炎、附件炎、子宫内膜炎、盆腔炎，严重的尿道炎甚至会导致女性不孕症或流产、死胎、宫外孕、新生儿低体重、脓滴眼、呼吸道感染等。
女性泌尿生殖系统结构的特殊性，女性的尿道较男性短且宽弛，细菌易于进入。尿道炎的危害可以影响身体和日常生活。急性尿道炎可引起各种不适症状。病菌在感染尿道后，会在尿道上造成脓疡，日后结疤的结果会使尿道狭窄，病患会感到小便困难及尿流细小。另外，分泌物增多，外阴瘙痒等症状，让不少女性尴尬不已。急性尿道炎可引发不孕症，摄护腺可能受到侵袭产生摄护腺炎，病患会有会阴部疼痛及下背部疼痛的症状，严重时会导致不孕。急性尿道炎的危害可造成关节炎。感染严重时，细菌侵犯到膝关节内会造成关节炎。影响后代：受感染的妇女生出来的孩子可能会患上结膜炎。女性患有急性尿道炎若是不及时的治疗，很容易引发女性的宫颈疾病，例如：宫颈炎症、宫颈糜烂等，并且还很容易引发女性的输卵管炎症、盆腔炎症、子宫内膜炎症等等的情况.
