中医认为出血性肠炎的病因在于饮食失调，偏食素餐及甘薯类食物，水谷精微匮乏，正气虚弱，感受邪毒，内舍小肠，分清泌浊失司，湿热内蕴，肠络受损，再加饮食不洁，进食生冷、霉变、腐烂食品，或复感时邪而诱发。湿热、瘀滞肠道为标，脾气虚陷、气阴亏虚为本，病性多属虚实夹杂。辨证治疗如下：
肠道湿热证
证候：腹痛阵发剧烈，呕吐频繁，大便水泻或为鲜红或暗红血便，恶臭，发热面赤，或高热谵语，烦躁或抽搐，舌红，苔黄腻，脉弦数或濡数。
治法：清利肠道湿热。
主方：葛根芩连汤合槐花散
加减：常加水牛角尖、丹皮、银花、赤芍；肠道瘀滞，加蒲黄、丹参、丹皮、赤芍；气阴亏虚，加西洋参、麦冬、山药、扁豆。
肠道瘀滞证
证候：腹部胀满，腹痛阵作较剧，呕吐频繁，腹泻鲜红或暗红血便，舌紫暗或有斑点，苔黄腻，脉弦涩。
治法：行气化瘀、和络止血。
主方：少腹逐瘀汤
加减：兼肠道湿热，去干姜、官桂、小茴香，加葛根、黄连、黄芩、藿香。
脾气下陷证
证候：腹胀痛，食欲不振，恶心呕吐，神疲倦怠，少气懒言，面色萎黄，大便稀溏带粘液，或为淡红色血便，或滑脱失禁，舌淡红，苔薄白，脉弱。
治法：补益中气。
主方：补中益气汤
加减：脾气不固，加乌梅、赤石脂、禹余粮；阴虚，加麦冬、石斛。
气阴亏虚证
证候：神志淡漠，烦躁不安，面色苍白或潮红，唇甲青紫，气短息微或气促，汗出涔涔，大便稀溏如赤豆汤或便血如注，舌红或淡红，苔薄黄，脉弱而数。
治法：益气滋阴、涩肠固脱。
主方：参芪益气汤
加减：兼肠道湿热，去附子、白术，加黄连、藿香、佩兰、苍术；肠道瘀滞，去附子，加丹参、丹皮、赤芍、蒲黄。
