生殖源性囊肿起源于尿生殖嵴的胚胎残余部分，在临床上较为少见。在胚胎发育早期，无论男性或女性，在尿生殖嵴内均有与生殖器相关的两套管道，即中肾管（包括中肾小管）及苗勒氏管，左右各一，二者在演变为成人器官时某些部分可残留，发生囊肿或肿瘤。在女性，苗勒氏管分化为输卵管、子宫及阴道，中肾管则退化，残余部分可在成人的卵巢、输卵管、阔韧带、子宫颈及阴道壁内形成加特纳囊肿。
