种痘并发症根据不同类型分别处理，具体治疗方法如下。
一、对病毒引起的皮疹
1、牛痘样湿疹、泛发性牛痘疹、坏疽性牛痘疹患者可用干扰素和干扰素诱导物及转移因子、人血丙种球蛋白或冻干人胎盘血丙种球蛋白（胎盘球蛋白）肌内注射、输入新近种痘者（4～8周内）血清和其他支持疗法。有发热和皮损广泛者，并用金霉素等抗生素治疗。
2、发生在角膜上的痘疮，需积极处理。局部以0.1％碘苷溶液（疱疹净）和0.5％金霉素滴眼液，每隔1h做轮换滴眼，并肌内注射冻干人胎盘血丙种球蛋白（胎盘球蛋白）或人血丙种球蛋白。
二、对过敏性皮疹
1、抗组胺类药物。
2、维生素C1g，静脉注射，每天1次。
3、重症患者可用皮质激素。
