苏拉明对非洲锥虫病早期疗效良好，其他药物有喷他脒、美拉胂醇（麦拉硫砷醇）等。对已累及中枢神经系统的病例，须采用有机砷剂进行治疗。美洲锥虫病感染早期用硝基呋喃胺或硝基咪唑类衍生物治疗有一定疗效。婴幼儿急性期感染者常预后不良，未经治疗已进入慢性期的患者只能对症处理。
