对于肠病毒感染目前并无很好的预防措施。除了脊髓灰质炎和甲型肝炎可通过相应的疫苗预防之外，其他的肠病毒感染目前尚无疫苗可供预防。婴幼儿应避免与急性发热的病人密切接触，注射γ－球蛋白或胎盘球蛋白也可以起到一定的预防作用。
