本病根据所划分的三类肿瘤不同的发病部位和临床特点，亦有不同的检查，具体的检查情况通常如下所示。
一、颅咽管瘤
1、内分泌功能测定：垂体功能减退者，基础代谢率降低，糖耐量常呈低平曲线或下降延迟，T3，T4，FSH，LH等各种激素测定均可降低。
2、头颅X线片：80％～90％的病人头颅平片有异常改变，主要表现有鞍区钙斑、蝶鞍改变（蝶鞍常呈盆形扩大、少数亦可呈球形扩大）、颅内压增高征（约见于60％病人）。
3、颅脑CT扫描:均于鞍区显示肿瘤的轮廓，瘤实质多表现为稍高密度或等密度影像，钙化组织则为高密度影像，囊腔为低密度，强化扫描实质部分大多有不同程度的影像增高，具有钙化，囊腔及强化影像增强三者，一般可以确诊。
二、上皮样瘤
1、头颅X线片:常有颅内压增高的表现。
2、颅脑CT扫描:显示为低密度影像，一般注射造影剂后影像不增强，个别的可见边缘有轻微增强。
三、生殖细胞瘤
1、头颅x线:平片一般均显示颅内压增高征，约40％可见松果体异常钙化，在儿童出现钙化，或成人钙化超过1厘米者，均为病理性。
2、CT扫描:大多显示高密度影像，亦可为等密度，常见钙化，两侧脑室扩大，注射对比剂后影像增强。
