本病中上皮样瘤和皮样瘤(皮样囊肿)起源于残余在颅内的胚胎上皮母细胞瘤。上皮样瘤只含外胚层成分，皮样瘤含外胚层及中胚层两个胚层成分，畸胎瘤则含三个胚层成分，皮样瘤及畸胎瘤很少见。生殖细胞瘤亦称非典型畸胎瘤，过去统称为松果体瘤。肿瘤发生自胚胎细胞，而非松果体实质细胞。
